人为气候变暖影响许多生物系统，范围从微生物群落到生物群落。在许多动物中，与变暖相关的适合度降低似乎与生态群落交互作用的变化关系更密切，而不是直接的热应激。这种生物群落框架通常应用于生态系统规模的升温研究，但很少应用于微生物群落规模。本文使用凤梨科微生态系统，以显示气候变暖对通过生物群落相互作用介导的蝌蚪肠道微生物组营养不良的影响。气候变暖改变了环境细菌和节肢动物的群落组成，与微生物募集的变化有关联，微生物的募集促进了营养不良并阻碍了蝌蚪的生长。蝌蚪的生长与气候变暖对肠道生态失调的级联效应的关系比直接变暖效应或对食物资源的间接效应更密切。这些结果表明，评估变暖对动物健康的影响需要微生物群落结构和功能的生态群落观点。

气候变暖是对动物健康和适应的全球性威胁，主要是通过生态群落相互作用的变化。利用生态群落框架来研究气候变暖对动物健康的影响，可能揭示出在这个群落环境之外无法察觉的重要趋势。宿主微生物群对动物健康的许多方面都至关重要，包括消化、发育、免疫和应激反应。以往研究气候变暖对微生物组的影响都不是设计来解释驱动温度介导的微生物组变化的生态群落因子，而是主要探索宿主相关细菌的直接温度响应或通过宿主生理介导的间接响应。然而，气候变暖对生物群落相互作用的影响可能是预测宿主相关微生物组的重要因素。

最近的工作已经开始解决微生物群落结构和功能如何受到生态群落相互作用的影响。生态系统扰动，如气候变暖，有可能破坏群落的相互作用，有助于微生物群落的完整性和宿主的适应性。通过生物群落相互作用介导的两栖动物肠道细菌微生物菌群失调的升温效应，是广受生态学家